2023年6月27-30日，Population Approach Group Europe (PAGE)在西班牙举办。在本次会议上，安渡生物展示了《apmx: an open-source R package for automated PK and PKPD dataset assembly》主题墙报。

 

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PAGE展会现场

 

该主题墙报由安渡生物定量临床药理数据科学经理Stephen Amori参与研究。

 

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apmx支持在NONMEM中汇整PK(PD)数据集。尽管R语言中提供了一些支持PK和PKPD数据分析的NONMEN工具，但很少有开源的R语言包可用于开发在NONMEN上分析的群体数据集。由于目前尚未有满足NONMEN规范的针对PK（PD）数据集的CDISC数据标准，定量药理研究员必须从一系列的源数据文件中整合自己的数据集，而分析数据集汇整对多试验设计的群体分析而言无疑费力且容易出错。手动检查丢失或异常数据极具挑战性，对非CDISC标准化数据则更甚。

 

自动化数据集的创建可确保数据集的一致性和可复现性，同时缩短项目时间并节省资源。apmx是一个开源R语言包，可在数据集汇整中完成以下任务：

  • 在R软件中整合可重现的且符合NONMEN规范的的群体PK（PD）数据集
  • 处理真实的源数据，包括CDISC SDTM/ADaM数据集或预处理的临床数据
  • 识别可能对分析产生负面影响的问题或可疑记录
  • 自动记录PK(PD)数据集，以支持内部组织和监管申报